O governo de Geraldo Alckmin fechou o ano de 2015 com um déficit orçamentário recorde. É o quinto ano seguido que o governo fecha as contas em dívida. A despesa total de 2015 foi de R$ 1,38 bilhão. Em 2014, o déficit foi de R$ 355 milhões. 

Muitas secretarias foram afetadas com cortes, como a Secretaria de Saneamento e Recursos Hídricos, que investiu 41% a menos de seu orçamento total previsto para o ano. O principal serviço afetado foi o tratamento de esgotos, que teve sua verba restrita em 69% do orçamento original.

As obras de metrô também foram afetadas, recebendo menor investimento. Somente R$ 85 milhões dos R$ 336 milhões previstos foram investidos na extensão da linha 9-Esmeralda.